Populous II setzt das Genre der „Götterspiele“ fort, das durch Bullfrogs Klassiker Populous begründet wurde. In PII sind Sie ein unbewiesener Unsterblicher, der sich durch ein ganzes Pantheon griechischer Götter kämpfen muss, von denen jeder seine eigene Strategie und seine eigenen Angriffe hat, um schließlich in einen Showdown mit Zeus selbst zu geraten.
Die Spielmechanik ähnelt der von Populous, aber PII bietet eine größere Auswahl an Zaubersprüchen, digitalisierten Sound und hochauflösende Grafik, um den Zaubereffekten mehr Nachdruck zu verleihen. Multiplayer wird über serielle Verbindung und Einwahl unterstützt.